motivo a dita con zinco

di Mariastella Zannini - Enciclopedia della Scienza e della Tecnica (2008)

motivo a dita con zinco

Mariastella Zannini

Sequenza polipeptidica che si trova in alcuni fattori di trascrizione ed è capace di riconoscere sequenze specifiche di DNA. Questo motivo contiene ripetizioni di residui di cisteina e istidina che legano ioni zinco e si ripiegano in strutture ad ansa (dita) che legano il DNA. Questo motivo fu identificato inizialmente nel fattore di trascrizione TFIIIA, richiesto dalla RNA PolIII per trascrivere i geni della subunità 5S del rRNA, ma è comune anche fra i fattori di trascrizione che regolano i promotori della RNA PolII. Tipicamente, le dita con zinco hanno per ogni dito la seguente sequenza consenso: Cys-X2-4- Cys-X3-Phe- X3-Leu- X2-His- X3-His. Il motivo prende nome dal cappio di amminoacidi che sporge dal sito di legame dello ione zinco, descritto come dito Cys2/Hys2. Le dita sono organizzate come una serie di ripetizioni in tandem che possono arrivare fino a 9 ripetizioni. I motivi a dita con zinco sono presenti in due tipi di proteine che legano il DNA: le proteine a dita con zinco classiche e i recettori steroidei. Una proteina a dita con zinco classica è per es., il fattore di trascrizione generale Sp1. Esso contiene un dominio a 3 dita con zinco, la parte C-terminale di ogni dito forma delle α-eliche che legano il DNA e la parte N-terminale forma un foglietto β. Gli amminoacidi non conservati nel C-terminale di ogni dito sono responsabili del riconoscimento di siti specifici. I recettori steroidei invece sono caratterizzati da un altro tipo di struttura a ‘dito’ che possiede la seguente sequenza consenso: Cys-X2-Cys-X13- Cys-X2-Cys. Queste sono chiamate dita Cys2/Cys2 e non sono ripetute, ­contrariamente ai motivi Cys2/His2. Esse riconoscono piccole sequenze palindromiche di DNA. Il glucocorticoide e i recettori per gli estrogeni, per es., hanno due dita ognuno: esse formano α-eliche che si avvolgono insieme a formare un largo dominio globulare. Questo motivo strutturale fu inizialmente identificato in domini che legano il DNA, ma ora si sa che è presente anche in proteine che non legano il DNA.

→ Fattori di trascrizione

Vedi anche
cisteina Amminoacido contenente zolfo, HOOCCH(NH2)CH2SH (acido α-ammino-β-tiolpropionico). È un costituente di molte proteine e il suo gruppo SH può essere facilmente ossidato da numerosi agenti ossidanti, incluso l’ossigeno molecolare; poiché la cisteina è presente nel sito catalitico di numerosi enzimi, la ... contròllo gènico gènico, contròllo Processo di regolazione che permette a una cellula di esprimere solo alcuni dei suoi geni. In un determinato organismo, tutte le cellule possiedono lo stesso patrimonio genetico, ma una cellula muscolare, per es., è diversa da una cellula del sangue: la loro diversa funzione deriva ... promotore biologia In biologia molecolare, sequenza di DNA di regolazione, cui si lega la RNA polimerasi per iniziare la trascrizione (sintesi di RNA). La corretta trascrizione di un gene sia nei Batteri, sia negli Eucarioti dipende dalla sequenza delle basi del suo promotore. In Escherichia coli (v. fig.) queste ... estrogeni Gruppo di sostanze naturali, semisintetiche (derivati di estrogeni naturali) e sintetiche, con attività biologica degli ormoni sessuali femminili, vale a dire partecipazione fondamentale nel mantenimento e nello sviluppo dei caratteri sessuali femminili secondari; nel controllo delle modificazioni dell’apparato ...
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Vocabolario
zinco
zinco (o żinco, region. żingo) s. m. [dal ted. Zink] (pl. -chi, region. -ghi). – Elemento chimico di simbolo Zn, numero atomico 30, peso atomico 65,38, appartenente al secondo gruppo del sistema periodico, sempre bivalente; è un metallo...
dita
dita s. f. [da una voce indigena delle isole Filippine]. – Albero delle apocinacee (Alstonia scholaris), proprio dell’Asia orient. e delle Filippine, la cui corteccia contiene diversi alcaloidi ed è usata in medicina come tonico, febbrifugo,...