GenBank

di Mauro Capocci - Enciclopedia della Scienza e della Tecnica (2008)

GenBank

Mauro Capocci

Database di sequenze nucleotidiche e delle loro traduzioni amminoacidiche, conservato presso il National Center for Biotechnology Information statunitense. Istituito nel 1982, GenBank ora fa parte della International Nucleotide Sequence Database Collaboration, insieme alla DNA DataBank of Japan e allo European Molecular Biology Laboratory. I tre istituti si scambiano quotidianamente i dati disponibili, che vengono inviati direttamente dai gruppi di ricerca. I dati, dopo gli appositi controlli, vengono pubblicati e sono liberamente accessibili tramite le diverse interfacce informatiche delle tre banche dati. L’annotazione di ogni sequenza è standardizzata e comprende un numero di indicizzazione, la sequenza completa di nucleotidi, l’organismo di appartenenza, i nomi dei ricercatori coinvolti nel sequenziamento, e tutte le informazioni necessarie per la localizzazione della sequenza all’interno del genoma. Nel giugno 2008, il database comprendeva oltre 92 miliardi di basi provenienti da più di 88 milioni di sequenze.

→ Microarray

Vedi anche
superorganismo In ecologia, gruppo di organismi o di comunità che sembrano avere proprietà, come omeostasi e riproduzione, simili a quelle di un singolo organismo. DNA Sigla del nome inglese dell’acido desossiribonucleico: desoxy- (o deoxy-) ribonucleic acid (➔ nucleici, acidi). DNA-polimerasi Enzimi che sintetizzano nuovi filamenti di DNA su un filamento di stampo.  ●Sia i batteri sia le cellule eucariotiche contengono più di una attività DNA-polimerasica, una permette ... nucleotide Glicoside formato dall’unione di uno zucchero a 5 atomi di carbonio (ribosio o desossiribosio) con una base azotata (purinica o pirimidinica) e con l’acido fosforico. Questi composti si trovano in natura come prodotti intermedi del metabolismo cellulare (ATP, ADP, AMP, GTP ecc.). Derivano anche dalla ... informazione Notizia, dato o elemento che consente di avere conoscenza più o meno esatta di fatti, situazioni, modi di essere. In senso più generale, anche la trasmissione dei dati e l’insieme delle strutture che la consentono. ● L’espressione tecnologia delle informazione è la traduzione italiana di information ...
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